Eugenia

А может быть проблема в запуске snakemake --cores all -p такого вида?

Коллеги, а кто-то в чате умеет в snakemake? Мне надо собрать много бактерий SPAdes-ом, а он переписывает папку. Скрипт не смогла. Snakemake вроде смогла но он мне больше полов...

Просто я вроде threads ограничила в spades, а оно валится. Видимо команда при запуске snakemake главнее чем та что в файле, так? Прошу прощения за глупые вопросы, я вроде перр...