Лена, ощущение, что вы где-то все же перекомпенсировали. А как вы настаивали компенсацию для этого случая? По одноцветным контролям? Вообще, может стоит тогда все проверить, с...
Ещё у Вас интересный гейт. Флуоресценции против FSC. А если выставить CFSE против другой флуоресценции? Не уверена, что это поможет, но может, стоит попробовать и сравнить?