@AKatsnelson возможно, дело в сортировке — по умолчанию пандас сортирует быстрой сортировкой, а она не stable зачем там вообще сортировать? или у нас предикт не сохраняет поря...
а сделать stratified, но не по таргету, по этой самой бинарной фиче? @greyxray