они что ядро все переписали?
шаблоны то в /local/ ?
вот в помощь - https://dev.1c-bitrix.ru/learning/course/index.php?COURSE_ID=43&LESSON_ID=2290
а что обмен был разовый? повторной синхронизации уже не будет?
другие агенты работают?
выгрузка в режиме изменений?
1С какая конфигурация?
и заработало?
mail php отправляет с сайта?