Читал про пакет dygraphs для визуализации временных рядов, может там что-то есть? Сам с ним не работал, поэтому это может быть пальцем в небо)
Саша, если я туплю, поправь меня, ты хочешь посмотреть эквивалентность корреляций на двух выборках?