Битрикс для разработчиков
Чат экстремального погром...
Qt
symfony
Ansible
Unity Engine: вопрос - от...
Nuxt.js | Vue SSR
Боты на Telegraf
Data Science Chat
Android Architecture
QA — русскоговорящее сооб...
DBA - русскоговорящее соо...
Tarantool
Unreal Engine
☁️ AWS_RU
Blender_ru: вопрос-ответ.
MongoDB Russian
Yandex Cloud - Официальны...
Git
DevsHelper
Big Data Science :: AI / ...
pro.kafka
3ds Max
1C
Вокруг да около Zigbee
Android Declarative
freebsd_ru
Atlassian Community - Rus...
Чат про Fusion 360 и 3D
OctoberCMS
ru_gitlab
Godot Engine (Russian)
MySQL
Yii Framework 2
Data Engineers
Чат Tableau
Cinema 4D
Evolution CMS
Odoo talks & fun
Software Design/Architect...
pro.buildsystems
Webpack — русскоговорящее...
Yii Framework 3
QA juniors
RUSCADASEC community: Киб...
ru_hashicorp
Grafana Loki
VictoriaMetrics_ru
.NET Group
Google Cloud Platform_ru
DevSecOps - русскоговорящ...
![Netbeans [RU]](https://image.telq.org/channel_avatar_1102508152_467588515831589735_mini.jpeg){kind=avatar}
Netbeans [RU]
Привет! я биолог, если точнее — работаю с нейронами, которые
умеют светиться при возбуждении. нам, лабкрысам, это нужно для того, чтобы описывать поведение этих нейронов в норме и патологии.
от графиков подобных пикрилу нужны только частота появления пиков и средняя амплитуда пиков. сейчас это делаем в эксельке, брр.
я хочу попытаться автоматизировать (хотя бы частично) этот процесс, но реализовать мозгов не хватает. помогите, плиз!
додумался пока до такого:
1. путь лентяя — автоматически искать все участки с восходящим трендом f′(x) > 0 и ростом свечения на 5+%.
2. путь самурая — заставить человека размечать все участки ручками (пикрил) и складывать в отдельную группу (или сет?); потом считать амплитуду по разнице между крайними значениями ненулевых участков. это всё ещё лучше эксельки, да.
что проще? в какую сторону копать? какие функции вам приходят на ум? (был бы рад спросить конкретное, но пока не знаю, что)
буду благодарен любому совету.
12 ответов
А как выглядит исходный датасет?
Нормально все с екселем, чем вам не нравится, типа потому что не модно?
По-английски задача называется change detection or change point detection. Наверняка есть готовые решения для Python или R (либо найти алгоритм и самим закодить)
magvag
Автор вопроса
А как выглядит исходный датасет?
колонка [time, s] и по колонке [Mean ##] со средней флуоресценцией для каждой клетки во момент времени. я за-pivot-ил [Mean]-колонки и теперь там столбцы [Cell Number] и [Cell Fluorescence]
magvag
Автор вопроса
Нормально все с екселем, чем вам не нравится, типа...
мне предложили просто находить пики на графике, спускаться в нужное место на таблице и руками размечать и обсчитывать каждый пик. просто потому, что сделать руками для небольшого эксперимента быстрее, чем вложить время в попытку автоматизировать.
мне предложили просто находить пики на графике, сп...
Вообще лучше power bi вам зайдет после екселя
magvag
Автор вопроса
По-английски задача называется change detection or...
скрипты очень не хочу, потому что не смогу сделать красиво и приучить к автоматизации всех в лабе. а для этого надо, чтобы всё work like magic — одна машина попотела и сделала csv, другой прям в браузере съела csv и показала красивый дашборд с размеченными пиками, настраиваемыми параметрами + всё посчитала
скрипты очень не хочу, потому что не смогу сделать...
Наймите програмистов
magvag
Автор вопроса
Вообще лучше power bi вам зайдет после екселя
спасибо, посмотрю в эту сторону после защиты диплома! табло был скачан давно и случайно — поэтому я даже не изучал альтернативы.
скрипты очень не хочу, потому что не смогу сделать...
тогда судя по тому что вы говорите проще реально руками разметить
magvag
Автор вопроса
Наймите програмистов
на это я деньги вряд ли выбью :)
magvag
Автор вопроса
кстати, автоматизировал мне надо было смотреть в сторону трейдинга :) находить значимые пики — всё равно, что искать бычие тренды. всем спасибо за советы и участие!
Похожие вопросы
Обсуждают сегодня