Alexander C

@olegkovale @ok55991 @aozalevsky @ivangushchin @ivankov13 Апдейт Альфафолда ?

🚀 @SBERLOGABIO webinar on bioinformatics: 👨‍🔬 Henrik Nielsen,Vineet Thumuluri , José Juan Almagro Armenteros "DeepLoc 2.0: multi-label subcellular localization prediction usi...

а ты этим занимаешься ?

А, никто не встречался с геном бактерий "fur" ? https://en.wikipedia.org/wiki/Ferric_uptake_regulator_family Transcriptional regulation by Ferric Uptake Regulator (Fur) in ...

Привет! такой вопрос - что конкретно означают цифры для ДЕ? например, Clotrimazole на NK cells дает 0.1047205 для гена A1BG. Как это интерпретировать? я поняла, что с сырыми...

@Marco_Scavenger не смотрел?

@Vtatarskii на каггл задачу ставят примерно так (упрощенно) вот дано действие драгов на транксрптом скажем Т клеток, предсказать надо для Б клеток На твой взгляд это содерж...

элайнмент выдает нам целое(!) число совпадаюищих букв. Чтобы перейти к процентам мы должны на что-то поделить - на что именно в случае ЛОКАЛЬНОГО выравнивания ?

@olegkovale @ok55991 @BurkovBA а если ещё пофилософствовать ,какой может быть минимальный набор , что было а) некоторое сходство с чем угодно, б) хорошее сходство с чем угодно...

@anvarki а что за это за датасет по глиомам ты собрал ?

А что случилось с "журнальным чатом" и запиненным сообщением с ботами ? чат переименовали, сообщения не вижу, или я не туда смотрю ?

а есть еще какие-то подобные гены которые тоже реагируют на многие стрессы ? и есть ли они тут в списке ? а почему VIM "везде" вылазит ?)

@ok55991 я вот не совсем понимаю если допустим мы знаем функции каких-то белков, теперь возьмём белки совершенно на них не похожие (скоры симилярити низки , е-валуе высоки, в...

А кто-то пробовал ankh модели protein language models ?