Похожие чаты

🚀 @SBERLOGABIO webinar on bioinformatics: 👨‍🔬 Henrik Nielsen,Vineet Thumuluri , José

Juan Almagro Armenteros "DeepLoc 2.0: multi-label subcellular localization prediction using protein language models"
⌚️ Thursday 27 July, 20.00 (Moscow time)

The talk will be in English. (It might be useful for CAFA5 Kaggle competition participants. Announcement on Kaggle.)

Add to Google Calendar

The talk will be based on the recent paper with the same title (Nucleic Acids Res. 2022 ).
The prediction of protein subcellular localization is of great relevance for proteomics research. Here, we propose an update to the popular tool DeepLoc with multi-localization prediction and improvements in both performance and interpretability. For training and validation, we curate eukaryotic and human multi-location protein datasets with stringent homology partitioning and enriched with sorting signal information compiled from the literature. We achieve state-of-the-art performance in DeepLoc 2.0 by using a pre-trained protein language model. It has the further advantage that it uses sequence input rather than relying on slower protein profiles. We provide two means of better interpretability: an attention output along the sequence and highly accurate prediction of nine different types of protein sorting signals. We find that the attention output correlates well with the position of sorting signals. The webserver is available at services.healthtech.dtu.dk/service.php?DeepLoc-2.0.


📹 Videos records are available : https://www.youtube.com/c/SciBerloga

Zoom link will be available in https://t.me/sberlogabig shortly before start of the talk.

1 ответов

26 просмотров
Alexander-C Автор вопроса

https://us02web.zoom.us/j/85437399900?pwd=QXZjcGNHaXpiYjRtUTlNMzZ1WXZDdz09

Похожие вопросы

Обсуждают сегодня

Ready for some fun AND a chance to win TKO Tokens? Join us for exciting minigames in our Telegram group! 🕒 Don’t miss out—games start on today 25 October 2024, at 8 PM! Ge...
Milkyway | Tokocrypto
255
Добрый вечер. Есть вопрос, а может и предложение. Был у меня диалог в другой группе о делфи и я задался вопросом: "А нельзя ли в делфи цвет //коментария и {комментария} сде...
Kraszx
24
How about the project bro Likes the community not that active ?
🅿️abby_FX
19
Всем привет! Подскажи, пожалуйста, как передать в TComboBox сразу значение и id записи. На Delphi я делал так: ComboBox1.Items.AddObject('Какое-то значение', Pointer(id запис...
Евгений
13
Мдя, прикол, боевая сборка запускается (именно под отладчиком) после F9 примерно полторы минуты (97 секунд если быть точным). Начал копать - проблема детектится сразу - зависа...
Александр (Rouse_) Багель
38
How are we going bro about the Raids ??
🅿️abby_FX
13
Россия стала ввозить сливочное масло из ОАЭ. Просто ради любопытства взглянул на статистику и впечатлился. У арабов среднестатистическая корова дает около 42 литров молока в д...
Foxcool
2
Здравствуйте, вопрос по структурам данных. Были у вас случаи, когда пришлось писать деревья или двунаправленные списки?
/ /
50
Товарищи, кто работа с iphelper? Или может я в самой логике ошибки фигачу, не пойму.... var ifTable : PMIB_IFTABLE; size, corSize: DWORD; Buffer ...
Warfarellen
4
я так понимаю, я так подозреваю, что создание такого плагина для человека, кто умеет писать плагины для делфи потребует минут 5-10 времени. но это мое подозрение. хотелось бы ...
Kraszx
7
Карта сайта