@Olegkovale @ok55991 @BurkovBA а если ещё пофилософствовать ,какой может быть

Question

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

@Olegkovale @ok55991 @BurkovBA а если ещё пофилософствовать ,какой может быть

минимальный набор , что было а) некоторое сходство с чем угодно, б) хорошее сходство с чем угодно в) отличное

300 генов Луки это "а" ? То есть если от них все произошло, то у всего живого сходство с одним из них ? Или не ?

Для эукариотов 2000-3000 генов ЛЕКА , это - "б" ?

0

11.06.2023

9 ответов

21 просмотр

Olga Kalinina

Мне кажется, это слишком общо поставленный вопрос. Опять же, предсказать функцию на уровне первой цифры ЕС — это одно, и может быть не супер-сложно (хотя бывают сюрпризы), а предсказать все вплоть до специфичности — совсем друга по сложности задача

0

11.06.2023

Alexander C Автор вопроса

Olga Kalinina
Мне кажется, это слишком общо поставленный вопрос....

А что за ЕС ?

0

11.06.2023

Olga Kalinina

Alexander C
А что за ЕС ?

https://en.m.wikipedia.org/wiki/Enzyme_Commission_number если ты в cafa играешь, то это просто мастрид

0

11.06.2023

Alexander C Автор вопроса

Olga Kalinina
https://en.m.wikipedia.org/wiki/Enzyme_Commission_...

Если есть ещё какие мастриды, ты накидай)))

0

11.06.2023

Alexander C Автор вопроса

Olga Kalinina
https://en.m.wikipedia.org/wiki/Enzyme_Commission_...

А энзим , не энзим это видно по структуре?

0

11.06.2023

Olga Kalinina

Alexander C
А энзим , не энзим это видно по структуре?

Не всегда, но часто

0

11.06.2023

Oleg K

Про сходство чего угодно с ЛУКОй - в рассуждении логическая ошибка. Эволюция на луке не закончилась и то, что всё произошло от луки не означает, что все современные белки на белки луки похожи. Не похожи - как только вторая копия гене выводится из-под действия отбора дупликацией - её может так перепахать, что ничего общего с первоначальной версией не обнаруживается. Всё зависит от эволюционного расстояния от дупликации до нашего времени.

0

11.06.2023

Alexander C Автор вопроса

Olga Kalinina
https://en.m.wikipedia.org/wiki/Enzyme_Commission_...

а никто не знает как это с Gene Ontology термами соотносится ?

0

11.06.2023

Boris A. Burkov · Accepted Answer

Boris A. Burkov

Я не знаю, всего в Pfam вроде ~20000 семейств и ~600 кланов? В CATH по-моему 6 тысяч superfamilies?

0

11.06.2023

Похожие чаты

@Olegkovale @ok55991 @BurkovBA а если ещё пофилософствовать ,какой может быть

9 ответов

Похожие вопросы