Привет! такой вопрос - что конкретно означают цифры для ДЕ? например,

Question

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

Привет! такой вопрос - что конкретно означают цифры для ДЕ? например,

Clotrimazole на NK cells дает 0.1047205 для гена A1BG. Как это интерпретировать?

я поняла, что с сырыми каунтами (уровень экспрессии гена) делают некий обсчет (модель Лимма) и получают fold-change in gene expression and a multiple-testing corrected p-value that a given gene's expression is dependent on the compound experimental variable Это подразумевает два числа.

далее написано: Your task is to predict differential expression values (то есть предсказываем кратность изменения, fold-change), а ниже:

the output of your model will be predicted signed -log10(p-values) for all 18211 genes. - а из этого выходит, что предсказываем пэ валуес

а в описании колонок с названиями генов de_train.parquet файла - genes A1BG, A1BG-AS1, …, ZZEF1 (numbering 18,211 in all) - Differential expression value (-log10(p-value) * sign(LFC)) for each gene.

так что все таки эти числа значат? формулу не понимаю((