без привязки к яп
эм... SQLAlchemy это ORM, а не инструмент ведения миграций. Для миграций там Alembic.
*Значит как Alembic
знаю только о существовании такого проекта, но никогда не пользовался. https://github.com/yandex/pgmigrate
gomigrate Ну или liquibase
liquibase flyway
Обсуждают сегодня