тема при совпадении названий объектов в разных пакетов, последний загруженный пакет скрывает/маскирует объекты ранее загруженных пакетов с совпадающими названиями. Фиксов 2: 1) обращение по pkg::obj и 2) изменить порядок загрузки пакетов так, чтобы «нужный» пакет был последним. Посмотреть порядок поиска можно с помоoью функции search(). От самих сообщений можно избавиться, добавив warn.conflicts = FALSE в library или обернув в suppressPackageStartupMessages.
Довольно развёрнутый ответ для углубленного самообразования: https://stackoverflow.com/a/39137111/1863950
Обсуждают сегодня