Подскажите, пожалуйста, как в датафрейме заменить character в строке по

Question

Подскажите, пожалуйста, как в датафрейме заменить character в строке по

позиции?
Скажем, у меня есть датафрейм с пептидами и мутацией, где, например, серин мутирует в метионин в 10 позиции
mydf <- data.frame(mutation.aa = rep("S10M", 10),
peptide = rep("AAAAAAAAASAAAAAAA", 10))И я хочу получить столбец, где будет как новая последовательность, так и старая. Пробую
mydf %>%
mutate(pos = as.numeric(gsub("\\D", "", mutation.aa)),
mut = str_sub(mutation.aa, -1, -1)) %>%
mutate(protein = paste(peptide, substring(peptide, pos) <- mut, sep=",")) %>%
head()Выдаёт ошибку
Evaluation error: replacing substrings in a non-character object
Если поставить as.character(), то интерпретатор совсем с ума сходит:
Evaluation error: could not find function "as.character<-".

#programming #r #russian

0

24.10.2018

2 ответов

19 просмотров

Артём Клевцов

Покажи ввод и желаемый вывод. 1 строка (не вектор).

0

24.10.2018

aGricolaMZ · Accepted Answer

aGricolaMZ

я бы предложил свести задачу к какой-то более маленькой. Потестить на одной строке, чтобы было понятнее...

0

24.10.2018

169 похожих чатов

Подскажите, пожалуйста, как в датафрейме заменить character в строке по

2 ответов

Похожие вопросы