- один граф. Гипотеза в том, что между группами есть значимые отличия в структуре графов. Как это проверить, не суммаризируя графы в простые и не шибко информативные метрики? Вот чтоб именно форму сравнивать
Вроде с igraph такое можно сделать, перевести граф в матрицу, например, или в лист
А как их в матричном виде сравнить... Мне не пакет интересен, а принцип
https://search.r-project.org/CRAN/refmans/foodingraph/html/compare_graphs.html
А статистический анализ разницы между группами графов?
Не знаю, не спецталист. Если кинут полезные ссылки, буду только рад)
вроде бы QAP-регрессия поможет. И моделирование с помощью ERGM. Пока сам в эту тему только погружаюсь, но сказали что эти 2 подхода как раз такие задачи решают
Сравнить модели может?
Какие сложные слова, спасибо, погуглю
Первое позволяет оценить вероятность случайного формирования одного графа из другого
Оппа, вот это звучит как самое то
Я как понимаю там происходит что-то вроде кучи симуляций графов из матрицы исходного и смотрится сколько раз получился ваш второй граф с которым сравниваете
Ага, и выходит если это дело забутстрапить и выбрать 10 тысяч случайных пар можно сравнить межгрупповую и внутригрупповую разницы?
Наверное да, просто я с такими задачи не сталкивался - графов было немного
Я тоже не сталкивался, я на будущее интересуюсь, но как только столкнусь - расскажу :)
Ой а я вот так подумал... А что, если тупо взять всю анову, и только функцию разницы двух точек сделать кастомной, мол, какой нибудь edit distance между двумя графами?
Пожалуйста одну вы батюшка графы не изучали вообще)))
Смотрите, что я нашел совершенно случайно https://search.r-project.org/CRAN/refmans/vegan/html/adonis.html
Обсуждают сегодня