с этой папки и не париться?
ну можете запустить clickhouse-backup clean на этой ноде если руками влом удалять
можно любые таблицы on cluster создавать это просто очередь для DDL запросов в ZK из которой все остальные ноды вычитывают запрос и исполняют https://clickhouse.com/docs/en/sql-reference/distributed-ddl/
Обсуждают сегодня