ReplacingMergeTree? У меня в такой таблице больше тысячи партиций из-за плохого ключа партиционирования. Знаю, что плохо, так получилось. И в какой-то момент OPTIMIZE перестали чистить дубли, которые туда попадали с последующим вызовом OPTIMIZE-ом. Может выполнение команды OPTIMIZE как-то ограничивается если партов/партиций слишком много или как-то так
Дубликаты из разных партиций удалятся не будут Можно ещё попробовать OPTIMIZE FINAL но он тяжелый
Обсуждают сегодня