Ну судя по запросу - выполняется подсчет товаров в категориях,

Question

Ну судя по запросу - выполняется подсчет товаров в категориях,

например для отображения меню или при переходе в категорию, содержащую сабкатегории.
Вообще подобный запрос даже на сайтах с малым количеством товаров желательно отключать.
Если меню большой вложенности, а в категориях много товаров, то запрос вообще пытается отправиться на марс, а время его выполнения стремится к бесконечности (надеюсь понятно, что я утрирую, но в вашем конкретном случае именно это и происходит). Ну и сервер увидев "зависший" запрос прерывает его, и выдает варнинг - мол: "ты что-то спрашивал? Если что, я не смог ответить, Давай по новой, Миша..." и фатал с текстом запроса.

Решение - отключайте подсчет товаров в категориях.
Система->Настройки->Опции->Подсчет товаров в категории - поставить "нет".

Ну и да, размер свободного дискового пространства тоже проверьте :)