антитело для задачи? Есть какой-то ресурс/база данных, или всё ручками по статьям? Мне нужно найти антитело, чтобы отличить раковые клетки Pan02 от здоровых клеток поджелудочной в ортотопной модели, а беглый гуглёж результатов не дал(
Ну по нормальным клеткам куча ресурсов, а так я бы посоветовал depmap есть там есть эта линия (или это мышь?) Я через полчасика могу глянуть.
Да, черт это мышь, тогда сложно :(
В нельзя ее просто трансдуцировать gfp? :)
Это было бы логично так сделать сразу, но так как мы собираемся мерить несколько разных флуорофоров на них, засунули только люциферазу(
Ну наверное не поздно ещё засунуть? :) (но нет так, так нет) А какая задача можешь уточнить? Вы собираетесь только поджелудку крошить? Почему гистология не подходит?
Задача в следующем: в поджелудочной мышей с раком есть популяция клеток, которые жрут наши адресные наночастицы как не в себя (MFI раз в 10 выше), а в здоровых такой пупляции нет. Классно было бы доказать, что это именно раковые, и жнлательно без особых мучений
А ваши призрачные частицы (хехехе) помечены флуорофором? Почему нельзя сделать срезы на криотоме?
Мне кажется самый простой способ взять ат к люциферазе, ат к gfp если флуорсеценция убивается фиксацией (но можно подобрать условия), фиксануть клетки метанолом, покрасить двумя ат или просто ат на люциферазу, и на проточник
Отсортировать наевшиеся и посмотреть, раковые ли? (Морфология, ядро, Поли/анеуплотдность)
Да, они помечены ковалентно
у нас есть транскриптом
о, слушай а у вас сами клетки можно взять?
Здравствуйте, было бы очень здорово. Только по транскриптомике мои знания более теоретические, чем практические, так что специальным софтом пользоваться я не умею)
Если там есть выгрузка в .tsv/.csv то тебе хватит экселя
Обсуждают сегодня