Похожие чаты

А можно наверное глупый вопрос: как вы делали многоцветное окрашивание,

если один из маркеров на ваших клетках не экспрессируется? Не очень понимаю что с чем в этом случае компенсировалось?

7 ответов

27 просмотров

Екатерина, спасибо! Это общее место при фенотипировании, когда заранее известно, что нужная популяция клеток является негативной по определнному маркеру, и позитивной по ряду других. При этом нам необходимо скомпенсировать засвет флюорохромов, имеющих перекрывающиеся спектры. При настройке компенсаций для негативного маркера я использовала бидсы, для остальных - клетки.

Kate-Bryushkova Автор вопроса
Elena Sazonova
Екатерина, спасибо! Это общее место при фенотипир...

Спасибо за уточнение. Негативный маркер - негативный для всех популяций образца? Фраза "все рецепторы находятся на одной клетке" относится к паре флуорохромов, один из которых гораздо ярче проявляется в одиночном окрашивании, чем в многоцветном?

Kate-Bryushkova Автор вопроса
Elena Sazonova
Да, верно.

Тогда из общих соображений, настраивая компенсацию по бидзам, которые очевидно имеют гораздо большую флуоресценцию, чем образец, вы кажется "убили" часть сигнала в целевом канале. Т. е. перекомпенсация как она есть

Kate-Bryushkova Автор вопроса
Elena Sazonova
Екатерина, спасибо! Как бы Вы работали?

Сложно ответить на ваш вопрос однозначно - зависит от ваших задач, количества флуорохромов, их сочетания на популяциях, яркости, свойств прибора итд итп. Но обязательную компенсацию по отдельным флуорохромам я очень давно не делаю (матрицу корректирую вручную, обычно этого достаточно). Использую в основном FMO, negative control и изредка какое-то новое/незнакомое антитело в сингл-формате, чтобы знать, что от него ожидать Но я не настаиваю на том, что мой способ верный :) можно написать мне в ЛС, чтобы здесь не флудить

Elena Sazonova
Екатерина, спасибо! Как бы Вы работали?

Мы тоже, как правило, делаем ФМО контроли и компенсацию настраиваем на клетках, а не на бидах (последние, как правило, светятся существенно ярче).

Похожие вопросы

Обсуждают сегодня

Ready for some fun AND a chance to win TKO Tokens? Join us for exciting minigames in our Telegram group! 🕒 Don’t miss out—games start on today 25 October 2024, at 8 PM! Ge...
Milkyway | Tokocrypto
255
Добрый вечер. Есть вопрос, а может и предложение. Был у меня диалог в другой группе о делфи и я задался вопросом: "А нельзя ли в делфи цвет //коментария и {комментария} сде...
Kraszx
24
Всем привет! Подскажи, пожалуйста, как передать в TComboBox сразу значение и id записи. На Delphi я делал так: ComboBox1.Items.AddObject('Какое-то значение', Pointer(id запис...
Евгений
13
Мдя, прикол, боевая сборка запускается (именно под отладчиком) после F9 примерно полторы минуты (97 секунд если быть точным). Начал копать - проблема детектится сразу - зависа...
Александр (Rouse_) Багель
38
How are we going bro about the Raids ??
🅿️abby_FX
13
я так понимаю, я так подозреваю, что создание такого плагина для человека, кто умеет писать плагины для делфи потребует минут 5-10 времени. но это мое подозрение. хотелось бы ...
Kraszx
7
Товарищи, кто работа с iphelper? Или может я в самой логике ошибки фигачу, не пойму.... var ifTable : PMIB_IFTABLE; size, corSize: DWORD; Buffer ...
Warfarellen
4
Здравствуйте, вопрос по структурам данных. Были у вас случаи, когда пришлось писать деревья или двунаправленные списки?
/ /
50
Keep saying it, it’s Trump or WW3. Iran will be emboldened if Harris wins by cheating. Israel will have to take the initiative against Iran. How has BTC faired everytime the...
Adz | Ferrum Network Product & Service Consultant @ Ferrum Network
1
Коллеги, добрый вечер. Создаю коллекцию от TFPGMap, ключ - перечисление, значение - целое. Нужно отсортировать коллекцию по значению. Как это можно сделать?
Kirill Filippenok
11
Карта сайта