А подскажите, пожалуйста, какой самый нормальный способ определять rotatable bonds

Question

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

А подскажите, пожалуйста, какой самый нормальный способ определять rotatable bonds

(вращательные связи?) в молекуле?
Алгоритм, который я видел, просто:
• строит граф молекулы
• по очереди удаляет рёбра графа и смотрит на связность
• если связность графа нарушена, то считает, что это ребро — rotatable bond.
Насколько это честный алгоритм с точки зрения химии?

0

10.05.2023

2 ответов

7 просмотров

Egor Marin

Egor Marin
не всё будет ловить -- можно представить себе три ...

хотя они и не rotatable в самом честном смысле этого слова, пожалуй.

0

10.05.2023

Egor Marin · Accepted Answer

Egor Marin

не всё будет ловить -- можно представить себе три кольца, соединённых по кругу одинарными связями. Тогда такой алгоритм будет выдавать ноль rotatable bond, когда в реальности ими будут все одинарные связи.

0

10.05.2023

Похожие чаты

А подскажите, пожалуйста, какой самый нормальный способ определять rotatable bonds

2 ответов

Похожие вопросы