Всем привет! Помогите, пожалуйста, разобраться с подбором праймеров Нужно подобрать праймер для

Question

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

Всем привет! Помогите, пожалуйста, разобраться с подбором праймеров Нужно подобрать праймер для

целого гена (BAP1, например)
Могу ли я просто взять уже подобранный праймер из https://www.origene.com/category/gene-expression/qpcr-primer-pairs ?
Или так делать нельзя, и надо обязательно подбирать под себя, нужно учитывать температуру плавления, размер области амплификации ?
//не сильно погружалась в тему подбора праймеров и ни разу не молекулярщик, cсорь, если тупой вопрос :(

0

19.05.2023

6 ответов

14 просмотров

Mary Sem Автор вопроса

Nastya
Посмотрите, не содержится ли в ваших образцах мута...

Я не очень поняла, а как посмотреть? Праймеры для ПЦР

0

19.05.2023

Natalia

Нужно проверить, нет ли продуктов с других генов (это можно сделать в Primer-Blast), нет ли димеров праймеров и всяких шпилек, насколько у них похожая температура плавления (желательно, чтобы разница составляла не более одного градуса). Ну и в любом случае перед постановкой уже целевой реакции уже на готовых праймерах на форезе нужно посмотреть отсутствие тех же димеров и нецелевых продуктов, а также раскапать эффективность праймеров.

0

19.05.2023

Natalia

Вам для реал-тайм ПЦР? Если нет, то требования могут быть менее жесткие

0

19.05.2023

Mary Sem Автор вопроса

Natalia
Вам для реал-тайм ПЦР? Если нет, то требования мог...

Реал-тайм, да

0

19.05.2023

Mary Sem Автор вопроса