Похожие чаты

А для чего в бам файле в заголовке у тэга

RG есть поле KS? В спецификации написано "KS The array of nucleotide bases that correspond to the key sequence of each read.", но если честно не понимаю, что это означает.

3 ответов

11 просмотров

In some embodiments, a read structure for a sequencing read with molecular tagging may include, starting from the 5' end, a library key, a barcode sequence, a barcode adapter, a prefix molecular tag, a sequence template, a suffix molecular tag, and a PI adapter. Base calling may include trimming the library key, barcode sequence and barcode adapter from the rest of the sequencing read and storing them in the key sequence (KS) tag field of the read group header @RG of the BAM file format Видимо, там может лежать отодранный от рида баркод или еще какая-то техническая последовательность.

Антон-Смирнов Автор вопроса
Marco Scavenger
In some embodiments, a read structure for a sequen...

Это цитата из спецификации?

Антон Смирнов
Это цитата из спецификации?

Нет, в спецификации как раз какая-то куцая фраза про array of bases corresponding to key sequences, это в патенте каком-то расписано.

Похожие вопросы

Обсуждают сегодня

Ready for some fun AND a chance to win TKO Tokens? Join us for exciting minigames in our Telegram group! 🕒 Don’t miss out—games start on today 25 October 2024, at 8 PM! Ge...
Milkyway | Tokocrypto
255
Мужики и девушки, привет) в Вelphi xe7 в настройках во вкладке "Editor Options" далее " Color" есть список: "Elements", открыв который мы можем настраивать отображение разных...
Kraszx
14
is that okay?
Samurai 🇯🇵
21
Добрый вечер. Есть вопрос, а может и предложение. Был у меня диалог в другой группе о делфи и я задался вопросом: "А нельзя ли в делфи цвет //коментария и {комментария} сде...
Kraszx
24
How about the project bro Likes the community not that active ?
🅿️abby_FX
19
Guys, Donald Trump or Kamala Harris? It does not matter for Bitcoin in the long run!! 2020 Election: After Joe Biden's victory in November 2020, Bitcoin steadily rose from...
Sabah Shabu
1
как быть с принтером? такой подход прокатит?
zamtmn
12
Всем привет! Подскажи, пожалуйста, как передать в TComboBox сразу значение и id записи. На Delphi я делал так: ComboBox1.Items.AddObject('Какое-то значение', Pointer(id запис...
Евгений
13
Мдя, прикол, боевая сборка запускается (именно под отладчиком) после F9 примерно полторы минуты (97 секунд если быть точным). Начал копать - проблема детектится сразу - зависа...
Александр (Rouse_) Багель
38
@brucezli Any info regarding ETA on updates?
Old Man Tom
10
Карта сайта