Подскажите, а где-то можно добыть исчерпывающий список всех митохондриальных и

Question

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

Antonina

Подскажите, а где-то можно добыть исчерпывающий список всех митохондриальных и

рибосомальных генов?

0

27.10.2023

10 ответов

31 просмотр

Antonina Автор вопроса

Marco Scavenger
Рибосомальные вроде тут есть, я брал когда-то. Вер...

Этот сайт нашла) но группы митохондриальных генов именно вроде нет, только отдельные можно найти. Мне бы если не полный список, хотя б паттерны в названиях, которые указывают 100%, что это митохондриальный ген. Есть такие?

0

27.10.2023

Alexander C

Antonina
Этот сайт нашла) но группы митохондриальных генов...

"МТ-***" не ?

0

27.10.2023

Marco Scavenger

Alexander C
"МТ-***" не ?

Кажется, там есть коварные без префикса. 😄

0

27.10.2023

Antonina Автор вопроса

Alexander C
"МТ-***" не ?

в прошлом опен проблемс да, так находились по крайней мере часть. А в текущей с МТ- и одного

0

27.10.2023

Alexander C

Antonina
в прошлом опен проблемс да, так находились по край...

Там без дефис кажется

0

27.10.2023

Arthur Zalevsky

по GO же.

0

27.10.2023

Antonina Автор вопроса

Arthur Zalevsky
по GO же.

это энричмент и затем поиск термов с ribosomal/mitochondrial ?

0

27.10.2023

Arthur Zalevsky

Antonina
это энричмент и затем поиск термов с ribosomal/mit...

зачем энричмент? просто выбираешь нужный тебе терм, например https://www.ebi.ac.uk/QuickGO/term/GO:0005739 а потом в энсемблевский biomart вбиваешь терм http://www.ensembl.org/biomart/martview/ef68812b6d186939db6987e0279147ad и получаешь нужные гены.

0

27.10.2023

Alisa Gorislav

https://doi.org/10.1093/nar/gki079 - ?

0

27.10.2023

Marco Scavenger · Accepted Answer

Marco Scavenger

Рибосомальные вроде тут есть, я брал когда-то. Вероятно, мито там тоже есть.

0

27.10.2023

Похожие чаты

Подскажите, а где-то можно добыть исчерпывающий список всех митохондриальных и

10 ответов

Похожие вопросы